Ein Zugang zu einer der Höhlen von Frasassi wurde am 28. Juni 1948 von einem Bauern entdeckt.
Weitere Zugänge wurden in den 50er und 60er Jahren von Mitgliedern des italienischen Bergsteigerverbandes (Club Alpino Italiano) aus den Nachbarstädten Jesi und Fabriano gefunden.
Große Teile des unterirdischen Komplexes wurden Anfang der 1970er Jahre entdeckt. Der gesamte Höhlenkomplex erstreckt sich über eine Entfernung von 13 Kilometern.

Ab September 1974 ist ein Teil der Höhlen für Besucher geöffnet. Über weite Wanderwege und großzügige Treppen ist eine 1,5 km lange Strecke angelegt.
Diese Touren werden von einem Reiseleiter in Italienisch, Französisch, Englisch oder Deutsch geführt.
Die Höhlen sind zu einer wichtigen Touristenattraktion der Region Marken geworden. Seit der Eröffnung haben mehr als 10 Millionen Menschen die Höhlen besucht.
Zusätzlich zu dieser Route gibt es eine blaue und eine rote speläologische Route für fortgeschrittene Enthusiasten.